甘肃中医学院附属医院创建于1991 年，是一所中医特色浓厚，临床科室齐全，并设有一家分院的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的三级甲等中医医院，是全国针灸临床研究中心甘肃分中心，甘肃省中西医结合肾病治疗中心设在本院，现为中华医院管理学会会员单位。
甘肃中医学院附属医院占地面积 17000 多平方米，总建筑面积 40000 多平方米 ，各类医用建筑面积 34000 多平方米，编制病床 400 张，全院职工 459 余人，其中博士生导师 1 人，硕士生导师 29 人，高级职称 94 人，中级职称 87 人， 1 人入选甘肃省“ 555 ”创新人才工程第一、二层次第二批人选， 4 人入选甘肃省“ 333 ”人才库， 5 人被评为甘肃省中青年学术技术带头人。有普内科专家于己百、周信有、贾斌、骨伤科专家宋贵杰、儿科专家张士卿、肾内科专家刘宝厚、消化科专家王道坤等 7 名全国和甘肃省名中医均在本院应诊。
甘肃中医学院附属医院设有内、外、妇、儿 等21 个临床科室；放射科、检验科、功能检查科等5 个医技科室；中医骨伤科学、中医儿科学、中西医结合临床、针灸推拿科学、妇产科学、中医临床基础、中医内科学、中医外科学8 个硕士生培养点。其中，中医骨伤科、中医儿科为省医疗卫生重点学科、省重点中医药专科；中西医结合呼吸科为省重点学科；中西医结合肾病科、神经心理科为省重点中医药专科；针灸推拿科 为全国针灸临床研究中心甘肃分中心、省重点专科建设单位、中医学院重点学科。十多年来，医院共完成省部级科研课题50 多项，获得省部级各类奖励20 多项。
甘肃中医学院附属医院配置有飞利浦螺旋CT、德国产全自动生化分析仪、日本产奥林巴斯胃肠镜、彩色多普勒超声诊断仪、经颅多普勒、脑电图，德国产800mAX光机，有先进的血气分析仪、多导睡眠分析仪、纤维支气管镜、骨密度仪等大型高精尖医疗设备。医院环境幽雅，十五层住院部大楼，设施齐全，病房宽敞舒适、干净卫生。门诊楼设计新颖、美观大方。建成10万级的符合国家GPP标准的制剂室，拥有颇具特色和疗效显著的内部制剂50余种。
甘肃中医学院附属医院为积极响应送医疗下社区的卫生政策，切实为人民群众解决看病难的问题，于2005年6月创办了甘肃中医学院附属医院拱星墩分院。分院地处兰州东大门，实用面积500多m2，设有内科、儿科、妇产科、针灸推拿科等临床科室和检验科、功能检查科等医技科室。分院交通便利，设备先进，人性化服务，科学化管理。由医院派专家坐诊，24小时应诊，双休日不休息。
多年来，甘肃中医学院附属医院始终坚持"以人为本"的服务理念和"以病人为中心的"服务宗旨，紧紧围绕"以病人为中心，以质量求生存，以改革创新谋发展，以加快发展为目的，突出中医特色，加强专科专病建设"的办院方针，科学管理，深化改革，不断加强硬件建设和软件建设，不断强化医德医风教育、提高诊疗水平、改善就医环境，救死扶伤，治病救人，为广大患者提供了更加人文化的诊疗环境和人性化的健康服务。目前，医院正朝着管理制度化、服务优质化、分配效能化、信息网络化、设备现代化的方向大步迈进。